يتكون الهيكل الإداري للأمانة العامة لمجمع الفقه الإسلامي الدولي كالتالي:

  1. ديوان معالي الأمين العام للمجمع، ويتبعه مباشرة المستشار الخاص لمعالي الأمين العام، ومستشار معالي الأمين العام لشؤون الإعلام، والمشرفة على ديوان معالي الأمين العام، والمشرف على مرصد الفتاوى والمراجعات، والمراقب الداخلي.
  2. إدارة شؤون الديوان والمراسم والشؤون القانونيَّة، ويندرج تحتها أقسام ثلاثة، وهي: قسم شؤون الديوان، وقسم شؤون المراسم والحركة، وقسم الشؤون القانونيَّة.
  3. إدارة التخطيط والتطوير والتعاون الدوليِّ والأرشيف والمتابعة، ويندرج تحتها أقسام ثلاثة، وهي: قسم التخطيط والتطوير، وقسم التعاون الدولي والعلاقات الخارجية، وقسم الأرشيف والمتابعة والتقويم.
  4. إدارة شؤون الأسرة والمرأة والطفولة والمُسنِّين، ويندرج تحتها أقسام ثلاثة، وهي: قسم شؤون المرأة، وقسم شؤون الشباب والطفولة، وقسم شؤون المسنِّين وذوي الاحتياجات الخاصَّة.
  5. إدارة الشؤون الإداريَّة والماليَّة، ويندرج تحتها أقسام ثلاثة، وهي: قسم الشؤون المالية والمحاسبة، وقسم الشؤون الإدارية والتدريب، وقسم المستودعات والمكتبة.
  6. إدارة الإعلام والعلاقات العامَّة وتقنية المعلومات والاتصال، ويندرج تحتها أقسام ثلاثة، وهي: قسم الإعلام، وقسم العلاقات العامَّة، وقسم تقنية المعلومات والاتصال.
  7. إدارة شؤون التمويل والاستثمار والمشاريع، ويندرج تحتها أقسام ثلاثة، وهي: قسم شؤون الوقف، وقسم التمويل والاستثمار، وقسم المشاريع.
  8. إدارة البحوث والدراسات والموسوعات والترجمة والطباعة، ويندرج تحتها أقسام أربعة، وهي: قسم البحوث والدراسات، وقسم الموسوعات والمعاجم، وقسم الترجمة، وقسم الطباعة والنشر.
  9. إدارة الدورات والمؤتمرات والندوات، ويندرج تحتها أقسام ثلاثة، وهي: قسم الدورات، وقسم المؤتمرات والندوات، وقسم الورشات والمحاضرات.

ديوان معالي الأمين العام للمجمع

إدارة شؤون الديوان والمراسم والشؤون القانونيَّة

ويندرج تحتها أقسام ثلاثة، وهي: قسم شؤون الديوان، وقسم شؤون المراسم والحركة، وقسم الشؤون القانونيَّة.

إدارة التخطيط والتطوير والتعاون الدوليِّ والأرشيف والمتابعة

ويندرج تحتها أقسام ثلاثة، وهي: قسم التخطيط والتطوير، وقسم التعاون الدولي والعلاقات الخارجية، وقسم الأرشيف والمتابعة والتقويم.

إدارة شؤون الأسرة والمرأة والطفولة والمُسنِّين

ويندرج تحتها أقسام ثلاثة، وهي: قسم شؤون المرأة، وقسم شؤون الشباب والطفولة، وقسم شؤون المسنِّين وذوي الاحتياجات الخاصَّة.

إدارة الشؤون الإداريَّة والماليَّة

ويندرج تحتها أقسام ثلاثة، وهي: قسم الشؤون المالية والمحاسبة، وقسم الشؤون الإدارية والتدريب، وقسم المستودعات والمكتبة.

إدارة الإعلام والعلاقات العامة وتقنية المعلومات والاتصال

ويندرج تحتها أقسام ثلاثة، وهي: قسم الإعلام، وقسم العلاقات العامَّة، وقسم تقنية المعلومات والاتصال

إدارة شؤون التمويل والاستثمار والمشاريع

ويندرج تحتها أقسام ثلاثة، وهي: قسم شؤون الوقف، وقسم التمويل والاستثمار، وقسم المشاريع.

إدارة البحوث والدراسات والموسوعات والترجمة والطباعة

ويندرج تحتها أقسام أربعة، وهي: قسم البحوث والدراسات، وقسم الموسوعات والمعاجم، وقسم الترجمة، وقسم الطباعة والنشر.

إدارة الدورات والمؤتمرات والندوات

ويندرج تحتها أقسام ثلاثة، وهي: قسم الدورات، وقسم المؤتمرات والندوات، وقسم الورشات والمحاضرات.